綠色熒光蛋白（GFP）是由兩個相當規(guī)則的內(nèi)涵一個α2螺旋和外圍保衛(wèi)11個β2折疊連的β2童裝結(jié)構(gòu)組成的二聚體。蛋白質(zhì)前段環(huán)化形成生色團，結(jié)構(gòu)可以人工改造，從而發(fā)出不同波長的熒光，且化學性質(zhì)穩(wěn)定，使其具有穩(wěn)定的發(fā)光能力。

藍色激發(fā)光源用于綠色熒光蛋白激發(fā)
綠色熒光蛋白的生色團在藍色照射下，會吸收藍色部分能量，然后發(fā)射出綠色的熒光，利用這一性質(zhì)，生物學家可以用綠色熒光蛋白來件標記幾乎任何生物分子或細胞，然后在藍色GFP激發(fā)光源照射下佩戴LUV-30A觀察眼鏡進行觀察。原本黑暗或透明的視場馬或是那個變得星光點點—即被標記了的活動目標。因為熒光蛋白發(fā)射的是熒光而不是磷光，需要GFP激發(fā)光源持續(xù)存在才可以連續(xù)發(fā)光。

不僅是綠色熒光蛋白具有被激發(fā)光源激發(fā)后發(fā)出熒光，其他的藍色、青色、紅色……熒光蛋白在相應的激發(fā)光源下均發(fā)出熒光。